Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms