Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rundc1Q0VDN7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms