Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms