Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms