Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms