Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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