Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Siah1bQ06985 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms