Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh3bp2Q06649 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms