Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms