Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Msx2Q03358 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms