Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms