Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nme2Q01768 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nme2Q01768 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms