Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms