Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col1a2Q01149 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms