Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms