Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms