Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gjb2Q00977 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms