Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Apoa1Q00623 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms