Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms