Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp9bP98195 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms