Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nkx3-1P97436 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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