Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Taf1bP97358 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf1bP97358 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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