Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl21cP86793 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl21cP86793 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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