Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms