Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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