Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Rpl39P62892 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms