Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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