Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vbp1P61759 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vbp1P61759 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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