Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P58686 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms