Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ctdsp1P58466 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms