Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gsc2P56916 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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