Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp5P56399 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp5P56399 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms