Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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