Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PctpP53808 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PctpP53808 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms