Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TgfaP48030 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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