Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms