Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PtgfrP43117 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms