Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TtlP38585 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms