Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Nedd1P33215 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nedd1P33215 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms