Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms