Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsx1P31315 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsx1P31315 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsx1P31315 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsx1P31315 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gsx1P31315 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gsx1P31315 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gsx1P31315 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms