Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kif5cP28738 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms