Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hoxd10P28359 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hoxd10P28359 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Hoxd10P28359 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd10P28359 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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