Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Defa5P28312 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms