Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtmaP26350 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms