Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PparaP23204 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PparaP23204 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PparaP23204 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PparaP23204 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PparaP23204 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PparaP23204 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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PparaP23204 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PparaP23204 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PparaP23204 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms