Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms