Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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