Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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NelfeP19426 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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NelfeP19426 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NelfeP19426 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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NelfeP19426 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NelfeP19426 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms