Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms